環境DNA解析ツール | eDNAmap・phyloBARCODER

eDNAmap

海洋環境DNAのメタバーコーディングデータを地図上にプロットします。

注目する配列や種を地図にプロット (収録あるいはユーザー独自の ASV table から)
類似した種組成の調査地点を検出
学名 (魚類) から生息環境を確認 (Fish Habitat)

ツールを開く使い方

本ツールの論文

Inoue J, Hirai J, Ikeba K, Yu Z, Ahmed SI, Lin Z, Lin Y, Wong MK-S, Shinzato C, Itoh S, Ito S-i, Saito H, Hyodo S. (2026). eDNAmap: A Metabarcoding Web Tool for Comparing Marine Biodiversity, With Special Reference to Teleost Fish. Molecular Ecology Resources 26: e70066. doi:10.1111/1755-0998.70066

phyloBARCODER

DNA配列から生物の種を判定します。

入力配列と参照配列の系統樹を推定し、種名と範囲を判定
4種類のデータベースを使い分け、動物・全生物（3ドメイン）・植物・菌類の種を判定
BLAST 検索による全 ASV 配列の種判定

ツールを開く使い方

本ツールの論文

Inoue J, Shinzato C, Hirai J, Itoh S, Minegishi Y, Ito S-i, Hyodo S. (2024). phyloBARCODER: A Web Tool for Phylogenetic Classification of Eukaryote Metabarcodes Using Custom Reference Databases. Molecular Biology and Evolution 41: msae111. doi:10.1093/molbev/msae111